木葉暗部

暗殺戰術特殊部隊，簡稱暗部，“暗殺戰術特殊部隊”，簡稱暗部類似於特種軍隊部門，暗部的成員都是從村子裡篩選出的優秀忍者，主要進行保護影和預防外敵侵入忍者村的工作，有時還負責偵察敵情和暗殺等任務，任務的性質一般極其惡劣或枯燥，比如看守重要疑犯等。由於任務的特殊性。其成員行動時都戴著模仿動物的白色麵具，任務性質及其他一切資料均被機密保存。暗部由影直屬，一切命令由影發布，部隊底下設多個四人或五人分隊，由分隊長統一轉達命令和領導執行任務。任務時都是以代號而稱的。

卯月夕顏（ユウガオ、26歲）：木葉暗部女上忍，紫色頭發，端莊乾練，美麗大方，火影護衛，擅長用刀，是月光疾風的戀人，多次出場。精通木葉流劍術，感知忍者，秘劍朧月夜；查克拉屬性疑似是風，擅長用卷軸封印處理屍體。

田路（タジ、蛇慈、23歲）：木葉暗部，女醫療忍者，猿飛琵琶湖的弟子。負責給漩渦玖辛奈接生，九尾之亂中被阿飛殺。

奇介：暗部忍者，茶色長發，因緣際會，被間諜寂留所殺，靈魂被封印，後被鳴人等複活。他的妻子是個美麗的黑發女性，喜歡鬱金香，被寂留殺害。

隻一：大胡子中年暗部忍者，山中花店常客，與井野感情很好。被血龍眼操縱變成人體炸彈，陣亡。

鏃火野子（14歲）：木葉暗部忍者，茶色長發梳著辮子，美麗的青年女忍者。才能出眾，被選為暗部，深受信任。使用光芒查克拉針攻擊，能夠跟蹤追擊，暗殺術。

朧：木葉暗部忍者，暗色火焰頭發的中年男子。能夠自由操縱查克拉量，擅長隱藏偽裝。

老虎（トラ、30歲）：木葉暗部，擁有極強的腳力，心狠手辣，負責狙擊逃走的忍者。負責監視宇智波一族的暗部忍者之一。

醜牛（ウシ、32歲）：千手扉間的直屬暗部，因擔心宇智波一族會出現造反，奉命日夜監視宇智波一族。

貘（バク、31歲）：率屬於監視宇智波一族的暗部成員，接受了準備鎮壓造反的命令。

大象（ゾウ、40歲）：三代火影時代的暗部護衛班班長，精通秘傳忍術，分析能力驚人。36歲時目睹了三代火影與大蛇丸在結界內交戰，並友情客串了解說員。

影（22歲）：火影直屬暗部成員1班成員，清秀的男子。佐井接近大蛇丸時，曾將他的情報交給大蛇丸。

羚羊（ガゼル、22歲）：五代火影綱手直屬暗部護衛班成員，長發女性，率屬於卯月夕顏小隊。能夠冷靜觀察敵人能力，分析出對策。（注：陣之書的新人物，個人感覺這人跟夕顏的角色重複，這是漫畫和動畫的衝突造成的。）

飛鳥：木葉暗部，發現了大蛇丸巢穴據點，但被藥師兜發現打傷，傳送回消息後自毀身亡。

根部

又稱“暗部培訓部門”，直接隸屬於木葉元老誌村團藏的獨立組織，即不受火影的管製，也不受暗部所管轄，製服是白色或黑色披風。所謂“根”之人冇有名字、亦無感情冇有過去亦無未來。心中隻有任務在背後支撐起木葉村這棵大樹的是深紮於大地之中的我等“根”的意誌。

信（シン）：佐井的義兄，蔚藍色頭發，兵器是一把斷刃。根部成員，做事有些慌慌張張。患上絕症過世。四戰中被穢土轉生，後自己擺脫，靈魂升天而去。

寺井（テライ、28歲）：根部成員，團藏命其搶在紅豆之前優先處理藥師兜，後下落不明。擁有不輸於油女取根和山中風的實力。

飛揚（ヒヨウ、日用、21歲）：根部成員，佐井的前輩，笑臉麵具，長發束辮子，曾多次出場傳遞團藏的命令，並在最後出手殺死和馬。（注：原著中並未參與和馬之亂。）

塔拉特吉姆：根部成員，負責監視紅豆，後下落不明。

乙丙丁：根部忍者，大和在根部時的隊友們。